孙策回到府中，早有内侍将此事传说给孙策的母亲吴太夫人知道。夫人叫来孙策，进入后堂对他说：“我听说你要把一个神仙下狱。这个人曾经医治过许多人的疾病，受到军民的敬仰，不应该加害于他。”孙策说：“这是个妖人，能用妖术迷惑众人，不能不除！”夫人再三劝解无果。孙策说：“母亲不要听信外人的妄言，我自有分寸。”
于是孙策出去叫来狱吏，要提审于吉。原来狱吏们都敬信于吉，在狱中时都除去了他的枷锁。等到孙策提审时，才又给他带上枷锁带出来。孙策得知此事后大怒，痛责了狱吏一顿，仍然将于吉用刑具拘禁在狱中。
张昭等数十人联名上书请求孙策释放于吉。孙策说：“你们都是读书人，怎么不明白事理？以前交州刺史张津听信邪教，结果被敌军所杀。这种事情毫无益处，只是你们自己还没有醒悟罢了。我要杀于吉正是为了禁绝邪教、觉悟迷途之人。”
吕范说：“我一向知道于道人能祈风祷雨。现在天气大旱为何不让他祈雨来赎罪呢？”孙策说：“那我就看看这个妖人能如何。”于是命令从狱中取出于吉解开了他的枷锁命令他登坛求雨。
于吉领命后即沐浴更衣取绳自缚在烈日之中。百姓观看的人填街塞巷。于吉对众人说：“我求三尺甘霖以救万民但我终不免一死。”众人说：“如果有灵验主公必然会敬重你。”于吉说：“气数至此恐怕不能逃脱了。”
不久孙策亲自来到祭坛中下令：“如果午时没有雨就焚死于吉。”先让人堆积干柴伺候。将到午时狂风骤起风过处四下阴云渐合。孙策说：“时间已经到了午时空有阴云而无甘雨正是妖人！”喝令左右将于吉扛上柴堆四下举火火焰随风而起。忽然看见一道黑烟冲上空中一声响亮雷电齐发大雨如注。顷刻之间街市成河溪涧都满了足有三尺深的甘雨。
于吉仰卧在柴堆之上大喝一声云收雨住又见到了太阳。于是众官及百姓共将于吉扶下柴堆解去绳索再三拜谢。孙策看见官民都跪拜在水中不顾衣服于是勃然大怒喝道：“晴雨是天地的定数妖人只是偶然乘便你们为何要如此惑乱！”他拔出宝剑命令左右迅速斩了于吉。众官极力相劝孙策发怒说：“你们都想跟从于吉造反吗！”众官才不敢再说什么。孙策喝令武士将于吉一刀斩首落地只见一道青气投向东北去了。孙策命令将于吉的尸体在市集示众以正其妖妄之罪。
当晚风雨交加，到了第二天早晨，人们发现于吉的尸体不见了。守尸的军士报告给孙策，孙策大怒，想要杀掉守尸的军士。突然，他看见一个人从堂前慢慢地走来，一看，竟然是于吉。孙策大怒，正要拔剑砍他，却忽然昏倒在地。左右的人急忙将他救入卧室，过了好一会儿他才苏醒过来。
吴太夫人来看望他，对他说：“我的儿子，你错杀了神仙，所以才招来了这场祸患。”孙策笑着说：“我自幼随父亲出征，杀人如麻，何曾因为杀人而招来过祸患？现在杀了这个妖人，正是为了消除大祸，他怎么能反而成为我的祸患呢？”夫人说：“因为你不信，所以才会有这样的事情发生。现在你可以做些好事来祈求消灾解厄。”孙策说：“我的命在天，妖人决不能成为我的祸患，何必去祈求什么呢？”夫人见他劝说无效，就暗地里命令左右的人去做好事来消灾解厄。
当晚二更时分，孙策躺在内宅，忽然阴风骤起，灯灭了又亮。在灯影之下，他看见于吉站在床前。孙策大喝道：“我平生发誓要诛杀妖邪，以安定天下！你既然是阴鬼，怎么敢靠近我！”他取过床头的剑扔向于吉，于吉却忽然不见了。吴太夫人听说后，更加忧愁闷闷不乐。孙策于是强撑着病体行动，以宽慰母亲的心。
母亲对他说：“圣人云：‘鬼神之为德，其盛矣乎！’又云：‘祷尔于上下神只。’鬼神的事情，不可不信。你错杀了于先生，难道就没有报应吗？我已经让人在郡中的玉清观内设坛祭祷，你可以亲自前去拜祷，自然就能安妥了。”孙策不敢违抗母亲的命令，只得勉强乘轿前往玉清观。道士将他接入观内，请他焚香。孙策焚了香却不谢神。忽然香炉中的烟起而不散，结成一座华盖的形状，上面端坐着于吉。孙策大怒，唾骂他；离开殿宇时，又看见于吉立在殿门口，怒目而视孙策。孙策问左右的人说：“你们看见妖鬼了吗？”左右的人都说没看见。孙策更加愤怒，拔出佩剑向于吉扔去，一个人被剑砍中倒地。众人一看，原来是前日动手杀于吉的那个小卒，被剑砍入脑袋，七窍流血而死。孙策命令将他扛出去埋葬了。等到出观的时候，又看见于吉走进观门来。孙策说：“这座观也是藏妖的地方！”于是坐在观前，命令五百名武士拆毁它。武士们刚上屋揭瓦的时候，却看见于吉立在屋上，飞瓦掷向地面。孙策大怒，传令逐出观内的道士，放火烧毁殿宇。火起的地方，又看见于吉立在火光之中。
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