在宇宙三分之一区域被虚无熵波侵蚀的危局中，十二把破碎的钥匙在陈默与林夏手中发出蜂鸣，钥匙表面浮现出流动的星图，指明了十二处晨曦法典残页的藏匿坐标。然而，当他们将钥匙插入金字塔顶端的凹槽时，整座建筑突然拔地而起，化作一艘刻满禁忌符文的巨型方舟，冲破柯伊伯带的暗物质云层，朝着最近的坐标——位于天猫座的「机械骸骨坟场」疾驰而去。
叶寒在与黑袍人的交锋中，发现这些神秘身影的黑袍下隐藏着半透明的躯体，体内脉络间流淌着紫色的虚无熵液。每当熵衡之匙的光芒触及他们，这些敌人便会分裂成多个残影，每个残影都携带着不同时间线的攻击模式。在激烈的战斗中，他的时熵沙漏出现了前所未有的紊乱，沙子时而凝固成尖锐的棱刺，时而化作液态逆流，将他困在一个不断循环的十秒时空牢笼中。
苏然与希望之灵深入可能性殿堂，发现殿堂的穹顶正在被虚无锈斑蚕食。每一片锈斑侵蚀的区域，都对应着一个文明失去希望的未来。他们在堆积如山的文明设想中寻找对抗之道时，突然遭遇修剪者残留意识的终极形态——一个由所有文明恐惧具象化而成的「心魔巨像」。巨像的手掌能将设想的蓝图捏成齑粉，口中喷出的黑雾所过之处，殿堂的墙壁开始渗出绝望的低语。
洛璃的舰队在突破黑色巨舰的防线后，发现舰桥核心的紫色晶体内部，封存着一个正在孵化的守门人胚胎。晶体表面流转的纹路与星骸坟场的紫色球体完美呼应，每一次脉动都引发周围空间的剧烈扭曲。当她试图用混沌熔炉吸收晶体能量时，舰体突然响起刺耳的警报：「检测到维度共振，启动最终净化程序。」黑色巨舰开始自我解构，化作无数紫色光粒，朝着星骸坟场飞去，在虚空中勾勒出一个巨大的召唤阵轮廓。
艾登与熵影幼体踏上收集信念结晶的旅程，首站来到机械文明的母星。这里的天空布满停滞的卫星残骸，地表的机械城市被一层黏性的紫色物质包裹，所有机器人陷入了「永无止境的自我检修」循环。他们在城市核心的中央处理器中，找到了被囚禁的「修复意志」结晶，那是一团由金色数据流组成的光茧，却被熵影吞噬者布置的「逻辑悖论陷阱」重重包围。每当艾登试图接近，陷阱便会生成无数自相矛盾的逻辑链条，将他的思维困在无尽的死循环中。
多元宇宙联盟的联合防线在虚无熵波的冲击下濒临崩溃。科技文明的「维度折叠炸弹」在投放后，反而被熵波转化为加速侵蚀的催化剂；魔法文明的星辰锁链刚触及紫色球体，便被分解成闪烁的星尘；量子文明的反物质黑洞计划，更是引发了局部空间的坍缩，吞噬了数十个星系。联盟总部的紧急会议室内，弥漫着绝望的气息，直到苏然通过记忆之树的网络传来振奋人心的消息：「晨曦法典的力量或许能逆转这一切，但需要所有文明的绝对信任！」
陈默与林夏乘坐的古神方舟抵达机械骸骨坟场，这里堆积着数以亿计的机械文明初代产物，每一个锈迹斑斑的齿轮都镌刻着远古的荣光。当方舟的船头触碰到坟场中心的巨型核心残骸时，十二把钥匙同时发出强光，在废墟中投射出一座由齿轮与法典残页交织的悬浮祭坛。然而，祭坛四周突然涌现出由机械残骸重组的「熵化守卫」，它们的身体能随意变形，时而化作吞噬一切的绞碎齿轮，时而变成发射虚无射线的炮台。
叶寒在十秒时空牢笼中不断重复着战斗与失败，逐渐摸索出黑袍人的弱点。他发现这些敌人的力量源自对时间线的扭曲操控，于是将时熵沙漏与熵衡之匙结合，创造出一个能同步观测所有平行时空的「时间棱镜」。通过棱镜，他看到黑袍人的真实身份竟是守门人从各个时间线抽取的「可能性残渣」，这些残渣被注入虚无熵液后，成为了毁灭可能性的利刃。当他将棱镜的光芒对准敌人，黑袍人的身体开始出现不稳定的分解。
苏然在与心魔巨像的战斗中，希望之灵突然化作万千光点，融入她的数据躯体。她的意识空间中，所有文明的希望记忆如潮水般涌来：原始人类在洞穴中绘制的第一幅星空壁画、星际殖民者第一次呼吸到外星空气时的泪水、不同种族共同建造的「宇宙之桥」竣工时的欢呼。这些记忆凝聚成一把金色的「希望之剑」，苏然挥剑斩向巨像，剑刃所过之处，恐惧化作璀璨的星光。
洛璃追随着黑色巨舰分解后的紫色光粒，发现它们在星骸坟场外围组成了一个巨大的环形防御带。每当有飞船试图接近紫色球体，防御带便会释放出融合了秩序与混沌的毁灭光束。她带领舰队改变战术，利用舞蹈产生的特殊频率干扰光束的频率共振，同时指挥熵舞者们在虚空中绘制出巨大的包容符文，将部分攻击能量转化为修复舰队损伤的治愈之光。
艾登在破解逻辑悖论陷阱时，熵影幼体突然主动融入中央处理器。它的身体化作无数翡翠色的程序代码，在数据洪流中穿梭，将自相矛盾的逻辑链条逐一修正。当修复意志结晶的光茧终于绽放时，艾登感受到了机械文明最纯粹的信念——「无论破损多少次，都能再次站起来」。结晶化作一道金色流光，融入他的光体，他的身上浮现出机械齿轮与希望光芒交织的纹路。
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