随着对各个遗迹研究的进一步深入，他们发现宇宙中的能量波动出现了一些异常的涟漪。这些涟漪似乎有着某种规律，但又难以捉摸。杰克怀疑这可能是新的威胁即将出现的信号。
为了查明真相，他们决定组建一支精英小队，驾驶着最先进的探索飞船，沿着能量涟漪的方向深入宇宙未知区域。这一区域充满了各种危险的宇宙现象，如猛烈的磁暴、神秘的引力漩涡和危险的星际尘埃云。
在穿越一片巨大的星云时，他们发现了一艘废弃的巨型飞船。这艘飞船的构造十分奇特，与他们之前见过的任何文明的造物都不同。杰克带领小队登上飞船进行调查。
飞船内部弥漫着一股神秘的气息，各种设备和仪器虽然已经停止运转，但依然能看出其曾经拥有高度复杂的技术。在飞船的主控室里，他们发现了一块巨大的晶体屏幕，上面闪烁着微弱的光芒。杰克尝试与飞船的系统连接，经过一番努力，成功获取了部分信息。
这些信息揭示了一个惊人的事实：在宇宙的边缘，存在着一个即将苏醒的古老威胁。这个威胁源于一个曾经被封印的黑暗文明，这个文明以吞噬其他文明的能量为生，曾经被超级文明用强大的力量封印在了宇宙的边缘。然而，随着时间的推移，封印的力量逐渐减弱，黑暗文明即将复苏。
杰克意识到，这可能是他们面临的最大挑战。他立即将这个消息传回到星际联盟总部。联盟迅速组织了一场全宇宙范围内的会议，各个星系的代表齐聚一堂，商讨应对策略。
会议上，各种观点和建议纷至沓来。有人主张再次寻找超级文明的力量来加强封印，有人建议直接对黑暗文明发动先发制人的攻击。杰克站出来提出了自己的想法：“我们对黑暗文明知之甚少，直接攻击可能会带来不可预估的风险。我建议我们先寻找关于这个黑暗文明的更多信息，了解他们的弱点，同时加强宇宙各个文明之间的联合防御体系。”
联盟最终采纳了杰克的建议。杰克和伙伴们再次踏上征程，他们沿着废弃飞船提供的线索，在宇宙中四处探寻。在一个偏僻的小行星带中，他们发现了一个隐藏的空间遗迹。这个遗迹似乎与黑暗文明有着某种联系，里面保存着许多关于黑暗文明的历史记录。
进入遗迹后，他们遭遇了一系列的危险陷阱。但经过之前无数次的磨练，杰克和伙伴们顺利地化解了这些危机，并成功解读了遗迹中的信息。
原来，黑暗文明虽然强大，但他们有一个致命的弱点，那就是他们的能量核心依赖于一种特殊的能量频率。只要能够干扰这个频率，就能让他们的能量系统崩溃。
得到这个关键信息后，杰克带领伙伴们迅速返回联盟总部。此时，联盟已经将各个星系的防御力量整合起来，形成了一个庞大的联合防御网络。杰克将黑暗文明的弱点告知联盟的科学家们，科学家们开始紧锣密鼓地研发能够干扰该特殊能量频率的武器。
然而，还没等武器研发完成，黑暗文明就已经提前苏醒。他们如同蝗虫过境般朝着宇宙中心扑来，所到之处，各个星系的能量都被疯狂吞噬，无数的星球陷入黑暗与死寂。
杰克和伙伴们驾驶着配备了新型武器的战舰，冲向黑暗文明的舰队。战斗异常惨烈，黑暗文明的战舰拥有强大的护盾和攻击力。但杰克他们毫不退缩，他们利用灵活的战术，不断地寻找着黑暗文明战舰的能量核心弱点。
终于，科学家们研发的干扰武器发挥了作用。当武器发射出干扰频率后，黑暗文明的战舰一艘接一艘地失去动力，能量护盾也随之崩溃。联盟的战舰抓住机会，发起了猛烈的攻击。
在这场惊心动魄的宇宙大战中，杰克再次展现出了他卓越的领导才能和英勇无畏的精神。他带领着联盟的勇士们，经过艰苦卓绝的战斗，终于将黑暗文明的舰队击退，将这个可怕的威胁重新封印在了宇宙的边缘。
经此一役，宇宙各个文明之间的联系更加紧密，他们共同成立了一个宇宙维和组织，由杰克担任首任指挥官。杰克和他的伙伴们将继续守护宇宙的和平与安宁，在无尽的宇宙探索征程中，随时准备应对新的挑战。
在杰克的领导下，宇宙维和组织逐渐发展壮大。各个星系的文明纷纷派遣最优秀的人才加入，共同致力于维护宇宙的和平与秩序。维和组织建立了一系列的监测站，分布在宇宙的各个角落，以便及时察觉任何可能出现的威胁。
然而，尽管表面上宇宙处于相对平静的状态，但杰克心中始终有一种隐隐的不安。他意识到，之前所遭遇的种种危机只是宇宙中众多未知危险的冰山一角。为了更深入地了解宇宙潜在的风险，他决定启动一个名为“宇宙奥秘探索计划”的项目。
这个项目旨在深入研究宇宙的起源、不同文明的发展历程以及那些隐藏在黑暗深处的神秘力量。杰克亲自挑选了一批各领域的顶尖专家，组成了多个探索团队，分别前往不同的目标区域。
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