齐王监国的第二个月，一场无声的风暴，在永京城看似平静的账册与公文往来中，骤然掀起。
得了齐王李景睿的明确授意与“便宜行事”的令箭，云湛的行动再无顾忌。他没有大张旗鼓地派人去各地漕运节点抓人查账——那只会打草惊蛇，让那些盘根错节的利益集团有时间销毁证据、串通口供。他将主战场，放在了户部、工部河渠司以及漕运总督衙门存档于京城的、浩如烟海的历年账目文牍之中。
云府书房旁边，专门辟出了一间宽敞的静室，门窗紧闭，日夜有可靠护卫把守。室内，数十口大樟木箱堆满了从各处调集来的漕运档案，时间跨度达十年之久。云湛从工部、户部挑选了八名年轻、背景相对清白、且精于算学的吏员（其中两人是“格物书院”的预选讲师，已受过云湛的基础数学培训），又从“云记”调来四名老账房，组成了一支十二人的核心审计团队。
他给这支团队下达了明确的指令：不问官职，不看名头，只盯着数字。以“格物致知、求真务实”为名，用他传授的新式复核方法，重新核算。
方法并不复杂，却超越了这个时代账房先生们习惯的流水记账、简单核验的模式。
首先是建立基准。云湛要求团队，先抛开那些充满“折耗”“漂没”“杂支”等名目的总账，而是从最原始的运单、交接单据、仓库存档入手，分年度、分航线、分船队，逐笔重建“理论运输量”与“理论损耗模型”。他根据运河不同区段的水文特点（枯水期、丰水期）、闸坝数量、船只标准载重与航行速度、粮食等物资的自然损耗率（考虑存储时间、气候），结合工部存档的历年运河维修记录，初步估算出一个相对合理的“理论最低损耗区间”。
然后，将官方案卷中每年上报的“实际损耗”数据，与这个理论区间进行比对。出入巨大的，标记为“异常一”。
第二步，横向对比与趋势分析。将不同年份、同一航段的损耗数据并列，观察其变化趋势。按理说，随着运河治理、船只改进，损耗率应呈缓慢下降趋势。但审计团队很快发现，在许多关键节点，损耗率不仅没有下降，反而在某些年份诡异地“跃升”，然后又回落，波动毫无规律可言，与当年的气候、水文记录完全对不上。这些“异常波动点”，被标记为“异常二”。
第三步，关联分析与交叉验证。云湛引入了“关联方”概念。他让团队将负责这些“异常”节点运输、仓储、巡查的官员名单列出，并与户部存档的官员升迁、调任、奖惩记录，以及工部存档的相关工程拨款、物料采购记录进行交叉比对。一个令人震惊的关联网络渐渐浮现：许多在损耗异常年份担任关键职务的官员，不久后便得到升迁或调任肥缺；而某些损耗异常高的年份，往往对应着该节点或附近河段有“大规模维修工程”，其工程预算也高得离谱。这些关联被标记为“异常三”。
更致命的是第四步：笔迹与印鉴的细节甄别。云湛从将作监调来了两位擅长摹刻、眼力极佳的老匠人，让他们仔细比对那些关键交接单据、损耗确认文书上的签名与官印。在放大镜（云湛用琉璃磨制的简易版本）下，一些破绽开始显露：某些不同年份、不同官员经手的文书，关键数字的笔迹却透出相似的书写习惯；一些官印的盖压轻重、角度、甚至边缘细微的缺损，在不同文件上呈现出不该有的高度一致，仿佛出自同一枚印章、同一人之手——这意味着，这些文件很可能是事后集中伪造、补签的！
静室内，算盘声、低声讨论声、纸张翻动声日夜不息。蜡烛换了一根又一根，每个人的眼窝都深陷下去，但精神却异常亢奋。他们正在挖掘一个隐藏在完美账目背后的巨大黑洞，每发现一处异常，每建立一条关联，都让这个黑洞的轮廓更加清晰，也更加触目惊心。
云湛坐镇中枢，每日听取汇报，梳理线索，调整方向。他如同一个最高明的弈手，在无数枯燥的数字和文书构成的迷宫中，一步步逼近真相的核心。
“大人！”这一日，一名年轻的户部吏员捧着一份汇总表，声音因激动而有些发颤，“淮安仓节点，近五年账目已初步复核完毕。仅以‘折耗银’一项为例，其账目所列损耗率，连续三年超出理论区间上限五成以上！而对比同期漕粮实际入库量与出库量差额，再结合当地气候档案，实际自然损耗最多只应有三成！差额部分，折合粮食每年超过八万石！这还只是一个‘折耗银’科目！”
另一名工部吏员紧接着汇报：“徐州闸段，‘船料维修补贴’与‘闸坝岁修银’两项，在永昌十八年、二十一年异常激增，账面支出比前后年份高出近三倍。但核对工部存档的当年实际维修记录与物料采购清单，所需费用不到账面的一半！且这两年的漕粮损耗率也恰好是峰值！”
“还有临清仓，”一位“云记”的老账房眯着眼睛，指着几份单据的影印副本（云湛让人用薄纸摹印关键页以备比对），“这几张不同年份的‘湿粮折价处理’确认书，下方几个仓吏的签名，运笔力道和收尾习惯，几乎一模一样！像是同一个人在不同时间仿签的！而且，用的印泥颜色、浓淡也过于一致了……”
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