然而，就在他们以为胜利在望时，基因塔突然爆发出比之前更强的紫光。苏晴的意识投影出现在两人面前，她的身体正在被基因代码逐渐吞噬，眼神中充满绝望：“来不及了...Omega 核心已经启动，除非...” 她的声音戛然而止，化作无数基因代码飘向基因塔。
林远看着手中逐渐消失的密钥碎片，突然想起父亲临终前的话：“真正的钥匙，在你心里。” 他握紧拳头，齿轮印记散发出耀眼的光芒，照亮了钟楼内隐藏的暗格。暗格里，放着一个向日葵形状的金属盒，盒盖上刻着一行小字：“致我的儿子，当齿轮与光明相遇，黑暗终将消散。”
林远颤抖着打开金属盒，里面躺着一枚镶嵌齿轮的金色怀表。当他将怀表贴近胸口，表盘突然浮现出父亲的全息影像，背景是熊熊燃烧的实验室：“孩子，向日葵是永夜生物最初的实验代号，而这枚怀表，藏着破解Omega核心的终极密钥——”话音未落，基因塔的紫光已穿透钟楼穹顶，将怀表包裹进扭曲的数据流漩涡。
怀表表面的齿轮开始不受控地疯狂转动，数据流如锁链般缠住林远的手臂。沈冽试图用电磁脉冲切断这股力量，却发现枪口喷出的蓝光竟被紫光吞噬。林远感觉心脏位置的齿轮印记传来灼烧感，父亲的全息影像在紫光中忽明忽暗，最后的口型定格成无声的警告，而整个市政厅的墙面开始渗出泛着荧光的基因黏液，如同一张正在收紧的死亡之网。
林远的机械义齿突然自动弹出防护膜，黏液腐蚀金属的滋滋声中，他瞥见怀表边缘浮现出半圈未完成的齿轮纹路。沈冽突然扯开衬衫露出背部，那里赫然纹着与怀表互补的另一半齿轮图腾，两人的齿轮印记同时迸发强光，将逐渐逼近的基因黏液逼退半丈。就在此时，基因塔传来一阵地动山摇的轰鸣，苏晴母亲的全息投影带着扭曲的笑容再次出现，她的指尖缠绕着暗紫色能量锁链，直取两人手中的怀表。
林远猛地将怀表按向沈冽背部的图腾，齿轮纹路瞬间咬合，迸发出的金色光芒如利剑刺破紫雾。苏晴母亲的锁链触碰到金光的刹那，发出刺耳的金属哀嚎，暗紫色能量开始急速坍缩。而市政厅的基因黏液突然逆流，在半空凝结成巨大的齿轮阵列，每一个齿牙都映照着两人父亲的面容，齿轮转动间，Omega核心的位置坐标在虚空中缓缓浮现。
林远还未从震撼中回过神，地面突然以齿轮阵列为中心剧烈下陷。苏晴母亲的全息投影发出尖锐嘶鸣，她的机械手臂化作无数基因飞刃，裹挟着暗紫色能量朝两人劈来。沈冽迅速举起电磁步枪扫射，子弹与飞刃相撞爆发出刺目火花，而基因塔方向，Omega核心启动的轰鸣如死神擂鼓，震得整个城市都在战栗。
林远在火花飞溅中瞥见齿轮阵列中心裂开缝隙，露出通往地下的螺旋阶梯，阶梯表面流转着与父亲实验室笔记相同的基因图谱光晕。他拽着沈冽纵身跃入，身后的飞刃擦着衣角将地面凿出深坑。下降过程中，机械腕表突然发出尖锐警报，三维地图上所有光点开始诡异地向Omega核心汇聚，仿佛整个城市的基因密钥正在被强行回收。
阶梯两侧的基因藤蔓突然暴长，如同巨蟒般缠绕上来。林远的机械义眼急速扫描，发现藤蔓表面竟布满了苏晴母亲的人脸纹路，那些扭曲的五官不断开合，发出令人毛骨悚然的尖笑。沈冽电磁步枪的能量条在持续消耗，每击断一根藤蔓，就有三根新的从黏液中窜出。两人在藤蔓的绞杀与飞刃的追击下节节败退，而螺旋阶梯尽头，Omega核心散发的暗紫色光芒正吞噬着最后一丝光明。
千钧一发之际，林远突然将手掌贴向最近的藤蔓。齿轮印记迸发的数据流如根须般钻入纹路，藤蔓上的人脸瞬间扭曲变形，发出痛苦的嘶吼。沈冽趁机调转枪口，瞄准藤蔓最密集处的黏液喷射口。电磁步枪的蓝光与基因藤蔓的紫光相撞，在爆炸的气浪中，两人终于看到阶梯尽头的Omega核心——那是一个悬浮在暗紫色能量场中的巨型齿轮装置，每一个齿牙都镶嵌着跳动的基因代码，顶端赫然插着他们追寻的所有密钥碎片。
林远的机械心脏几乎要冲破胸腔，齿轮印记与巨型齿轮装置产生的共鸣震得他耳膜生疼。沈冽的电磁步枪突然发出过载警告，蓝光黯淡的瞬间，基因藤蔓如潮水般重新合拢。就在这生死关头，林远怀中的金色怀表剧烈发烫，表盘浮现的齿轮纹路竟与Omega核心的结构完美契合，暗紫色能量场开始出现蛛网状裂痕。
苏晴母亲的全息投影突然撕裂空气般出现，她指尖凝聚的暗紫色能量球骤然膨胀，“愚蠢的蝼蚁！以为凭这点伎俩就能摧毁Omega核心？”话音未落，能量球化作万千基因锁链，如毒蛇般缠住两人脚踝，将他们向核心反向拖拽。林远感觉齿轮印记传来撕裂般的疼痛，怀表表面的齿轮纹路开始渗出金色血液，在暗紫色能量场中晕染成燃烧的向日葵图腾。
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