在一个静谧的夜晚，一颗神秘的天外陨石如流星般划破天际，最终坠落于圣坛以东五百公里处的一座荒芜之岛。
此陨石携带着一种前所未见的未知细菌，在陨石撞击地面后，这种细菌迅速蔓延开来。出乎意料的是，这种细菌在短短二十四小时内发生了惊人的异变，它转化为一种极其恐怖的“丧尸病毒”。
这种病毒具有超强的传染性，一旦感染，人类会即刻丧失意识，变得极具攻击性，宛如行尸走肉。
随着时间的流逝，这种“丧尸病毒”以惊人的速度扩散着。短短三天，它便已席卷了三座沿海城市，无数人被感染，城市陷入了一片混乱与恐慌之中。街道上充斥着疯狂的丧尸，它们追逐着幸存的人类，血腥与暴力弥漫于城市每一个角落。
龙组成员“夜”身着玄色战斗服，手中 “龙渊战刃” 泛着淡金色光芒，一刀劈开扑来的丧尸头颅，转头对身后的特情局十七组组长沈明亮喊道：“卫星监测到陨石坑附近有暗影会的能量波动！他们肯定在利用病毒搞事！”
沈明亮操控着 “星核能量探测仪”，屏幕上暗黑色的能量轨迹正朝着百慕大三角方向延伸：“探测到病毒中含有星核能量因子，与五年前我们在百慕大遇到的暗影会实验能量一致，” 他顿了顿，补充道，“而且，百慕大方向传来哥斯拉的能量波动，强度比五年前提升了三倍 —— 它似乎也感知到了末日危机。”
这句话如钥匙般打开了“夜”的记忆闸门 —— 五年前，他与沈明亮正是在百慕大三角，首次遭遇暗影会的星核能量实验，也是在那里，他们第一次见到了哥斯拉，甚至与星穹族行星级强者银穹的能量残魂产生了共鸣。那段被尘封的过往，随着眼前的末日危机，逐渐清晰地浮现出来。
【倒叙：五年前?百慕大三角外围?星核能量实验基地】
地球纪元 2020 年 10 月，正是星穹族强者银穹降临地球的当月。龙组接获线报，暗影会在百慕大三角外围的一座废弃石油平台上，秘密进行 “星核能量生物改造实验”—— 他们试图用星核能量污染海洋生物，制造出可控的 “星核能量怪兽”，以此破坏百慕大的生态平衡。夜与沈明亮带领两支特战队，搭乘隐形舰艇前往调查。
废弃石油平台下的海底实验室中，弥漫着刺鼻的星核能量气味。沈明亮操控 “微型探测机器人” 传回的画面显示，暗影会的研究员正将暗黑色的星核能量药剂注入捕获的巨型章鱼体内 —— 章鱼的体型以肉眼可见的速度膨胀，触手表面浮现出暗黑色的星核能量纹路，原本温顺的生物变得极具攻击性，一触手就拍碎了实验室的合金容器。
“他们在复刻‘星核能量丧尸’的早期实验！” 夜握紧龙渊战刃，“一旦实验成功，这些星核能量怪兽会顺着洋流扩散，百慕大的生态会彻底崩溃！” 就在他准备下令突袭时，实验室外的海水突然剧烈波动 —— 一道淡蓝色的能量冲击波从百慕大方向传来，平台的合金支架开始剧烈震颤，实验室中的星核能量仪器瞬间失控。
“是哥斯拉！” 沈明亮的探测仪上，一道巨型能量信号正快速靠近，“它的能量波动与星核能量完全对立，似乎是在清除星核能量污染！” 话音刚落，实验室的玻璃穹顶突然被一道巨型触手击碎 —— 正是那只被星核能量改造的章鱼，它挣脱了暗影会的控制，朝着舰艇的方向袭来。
就在这危急时刻，海面突然掀起数十米高的巨浪 —— 哥斯拉的庞大身躯从海底升起，背部棘刺泛着淡蓝色的能量光芒，它朝着星核能量章鱼喷出一道巨型火焰，火焰中夹杂着纯净的生态能量。星核能量章鱼的触手被火焰击中，表面的星核能量纹路瞬间被净化，体型也快速萎缩，最终化为一堆无害的海洋生物组织。
“这就是…… 传说中的哥斯拉？” 特战队成员惊叹道。夜却注意到，哥斯拉的背部棘刺上，浮现出一道银色的能量纹路 —— 这道纹路与他随身携带的 “星穹能量碎片”（龙组从罗斯威尔事件遗址中获取的信物）产生了强烈共鸣，碎片表面浮现出一行模糊的星穹族文字：“星穹守护?生态清除”。
“有人在操控哥斯拉的能量！” 沈明亮突然喊道，他的探测仪捕捉到一道微弱的银色能量信号，正从百慕大三角深处传来，“信号强度达到‘行星级’，不是地球生物能拥有的能量等级！”
就在这时，暗影会的首领 —— 身着暗金色战甲的 “玄一” 从实验室中走出，手中握着一把 “星核能量核心杖”：“夜，沈明亮，别以为有哥斯拉帮忙就能阻止我们！” 他挥动核心杖，一道暗黑色的星核能量冲击波朝着哥斯拉袭来，“我们已经感知到星穹族的存在，只要吸收了哥斯拉的能量，再破坏百慕大的灵气核心，地球就是我们的了！”
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