天授九年（926年）四月，甄萱的人质真虎病死，甄萱怀疑是王建故意所为，便杀了王信，两国关系再度破裂。甄萱陈兵熊津，进攻高丽，王建命各城坚壁不出。新罗建议王建一举消灭后百济，但王建说：“不是我害怕甄萱，而是要等他恶贯满盈而自取灭亡。”翌年正月，王建联合新罗夺取后百济的龙州，三月打败运州城主兢俊，取近品城，四月派海军将军英昌、能式等率水师攻打康州（今韩国庆尚南道晋州市），占领了突山等四乡。王建又亲征熊州（今韩国忠清南道公州市），但未能攻克。随后，王建亲自前往康州，城主兴达及后百济官吏都投降了高丽。
天授十年（927年）九月，新罗国相金雄廉打算邀请王建来新罗都城金城（今韩国庆尚北道庆州市），强化对后百济的围堵。甄萱得知后，率兵进攻新罗，新罗景哀王遣使告急于高丽。王建派侍中公萱领兵人救援，途中得知金城被甄萱攻破、景哀王自杀的消息。王建大怒，亲率精锐骑兵5000人，在公山（今韩国大邱广域市八公山）桐薮邀击从金城凯旋的甄萱，结果反被甄萱击溃，大将申崇谦、金乐为掩护王建而战死，王建仅以身免。甄萱乘胜取大木郡、侵碧珍郡，烧毁田野积聚，这是王建一生中最惨痛的失败。其后，吴越国派班尚书来调停高丽和后百济的冲突，王建和甄萱互相致书，指责对方背盟。
天授十一年（928年）五月，甄萱袭取康州，杀三百余人。七月，王建征讨三年山城（今韩国忠清北道报恩郡），未能攻下，便前往清州，遭百济军围攻。庾黔弼率军来救，击退百济军，杀获300余人，经此胜利，王建才稍微心安。十一月，甄萱率精兵夺取乌于谷城，杀一千人，将军杨志、明式等六人投降甄萱。王建下令将这六人的妻子弃市，以示惩戒。
天授十二年（929年），甄萱入侵义城府、顺州等地，至十二月，甄萱又包围古昌郡（今韩国庆尚北道安东市）。王建率兵往救，于翌年正月在古昌郡瓶山大破甄萱，杀8000余人，一举扭转了高丽被动的局势。
五、一统三韩
古昌大捷后，王建与新罗敬顺王金傅通好，同时将新罗东部沿海从溟州（今韩国江原道江陵市）到兴礼府（今韩国蔚山广域市）110余城纳入版图。这一胜利不仅巩固了高丽的东疆，也为王建统一朝鲜半岛奠定了坚实的基础。天授十四年（931年）三月，王建亲至金城，会晤金傅，金傅送堂弟金裕廉为人质，进一步巩固了高丽与新罗的友好关系。
天授十五年（932年），王建派王仲儒（王儒）出使后唐，请求册封。天授十六年（933年）三月，后唐明宗所派使臣王琼、杨昭业来到高丽，册封王建为特进、检校太保、使持节、玄菟州都督、上柱国、充大义军使、高丽国王，封神惠王后柳氏为河东郡夫人。王建遂停用天授年号，改用后唐长兴年号。这一册封不仅提升了王建的国际地位，还为他统一朝鲜半岛提供了更多的政治资本。
同年夏天，王建派征南大将军庾黔弼阻止百济入侵新罗，在槎滩、子道等地大破甄神剑所率的百济军，保住了新罗。这一胜利不仅巩固了高丽与新罗的联盟，还削弱了后百济的实力。
清泰元年（934年）九月，王建亲征运州（今韩国忠清南道洪城郡），甄萱求和。庾黔弼主张“今日之势，不容不战”，便以数千骑兵大破后百济5000甲士，斩获3000余级，熊津以北30余城都归降高丽。这次胜利进一步削弱了后百济的势力，为高丽的统一创造了有利条件。
清泰二年（935年）三月，后百济发生宫廷政变，甄萱之子甄神剑囚父自立。六月，甄萱逃到罗州，投降高丽。王建派庾黔弼等从海路将甄萱接到开京，尊为尚父，位在百官之上，赐杨州为其食邑。这一举措不仅安抚了甄萱，还削弱了后百济的内部凝聚力。受此影响，新罗王金傅也于十月纳土归降，十一月亲自入朝开京。王建起初推辞，最终接受让国，遂封金傅为政丞，位在太子之上，以金城（后改称庆州）为食邑。这一系列举措不仅巩固了高丽的统治，还为王建的统一事业扫清了最后的障碍。
清泰三年（936年）二月，甄萱的女婿朴英规秘密通款高丽，愿为内应。其后甄萱也请求王建出兵消灭逆子。王建经过权衡，于六月派正胤（太子）王武和将军朴述熙领兵一万前往天安府，预备征讨后百济。其后王建亲自率领三军共余人出征，九月八日在一利川（今韩国庆尚北道龟尾市的洛东江支流）与神剑展开决战。刚开战便有百济左将军孝奉等倒戈投降，后百济军不堪一击，迅速溃败，被斩5700余级。高丽军乘胜追至马城（今韩国全罗北道益山市弥勒山城），神剑等被迫投降，后百济灭亡。
随即，王建进入后百济都城全州，一路上“存问将士，量才任用，军令严明，秋毫不犯”。他不仅安抚了后百济的残余势力，还赢得了民心。其后，王建凯旋开京，登威凤楼，接受文武百官及百姓的朝贺。至此，王建完成了一统三韩的大业，朝鲜半岛迎来了一个崭新的时代。
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