那只黑蝶消失后的第七天，小燕子发现学校的音乐教室每晚都会传出隐隐约约的琴音。当她壮着胆子再次踏入时，墙上的血迹竟重新浮现，拼凑成一行猩红的文字：“祭品未全，仪式重启”。与此同时，尔泰开始变得越发古怪，他的手机相册里不知何时存满了小燕子的照片，每张照片上都被标记着类似祭祀流程的符号。
周末，小燕子在图书馆查阅古巫族资料时，偶遇了一位白发苍苍的老者。对方看到她脖子上若隐若现的淡金色纹路（接触玉佩留下的痕迹），脸色骤变：“孩子，你被选中了！每隔三十年，歌神就会借由大赛重生，而上次失败的祭祀，让你成了连接阴阳的容器。”老者塞给她一个铜铃，“听到特殊音律时摇动它，能短暂破除蛊惑。”
当晚，校园歌手大赛的海报突然铺满整个学校，而举办时间赫然定在三天后的午夜。更诡异的是，全校师生都对此习以为常，仿佛时间被重置了一般。小燕子带着铜铃找到尔泰，却发现他正在组织新的参赛者排练，那些人眼中闪烁着和曾经文艺委员一样的青光。铜铃突然发出刺耳的响声，尔泰浑身一震，短暂恢复清明：“快逃...我的意识快被吞噬了，他们要在旧礼堂用你的声音打开阴阳通道！”
旧礼堂内，巨大的祭坛已经成型，祭坛中央摆放着那把曾属于尔泰的黑色吉他。当小燕子被参赛者包围时，老者带着一群神秘人破门而入——他们竟是古巫族最后的守护者。双方展开激烈对峙，混乱中小燕子抓起吉他，凭借记忆中安魂曲的变奏，配合守护者们的咒语，与黑暗力量展开最终对决。随着激昂的旋律达到高潮，祭坛轰然倒塌，黑蝶从尔泰体内冲出，却被老者用符咒封印。然而，战斗结束后，老者神色凝重地说：“歌神的核心并未被摧毁，它只是在寻找下一次机会...”
樱花反季节盛放的那天，小燕子和尔泰在花瓣雨中发现了一个全新的时光胶囊。这次的胶囊表面刻满了精密的齿轮，打开后里面只有一部老式手机，收件箱里躺着一条未读消息：“2035年6月17日14:23，钟楼将成为时间漩涡的中心，唯有找到初代时光胶囊才能阻止崩塌。”发送人显示为“未来的你”。
两人顺着线索追查，竟发现初代时光胶囊被埋在学校最古老的槐树下。挖掘时，陈平安校长突然现身，他手中拿着一把银色钥匙，眼神复杂：“我等这一天，等了二十年。当年我篡改时间，是为了修正一个更大的错误——我的女儿其实死于时间悖论，而现在，该做个了断了。”
钟楼顶层，时间漩涡正在形成，无数条交错的时间线如同彩带般缠绕。他们发现初代时光胶囊里存放着一本日记，记录着二十世纪一位天才少年为了拯救病重的妹妹，试图用时光胶囊改变命运，却意外制造了时间乱流。而那位少年，正是陈平安年轻时的模样。
随着时间漩涡不断扩大，现实开始扭曲。小燕子、尔泰和陈平安被困在混乱的时空碎片中，他们时而回到过去的校园，时而坠入未来的废墟。关键时刻，女生的意识再次出现，她引导众人将三部时光胶囊（初代、十年前、新出现的）同时放入漩涡中心。耀眼的光芒中，所有时间线开始融合重组，陈平安的女儿从虚空中浮现，微笑着拥抱父亲：“爸爸，该让一切回归正轨了。”
最终，时间恢复平静，陈平安选择离开学校，去寻找新的生活。小燕子和尔泰看着重新变得正常的校园，手机突然收到一条来自陌生号码的短信：“时间的故事永远不会结束，但你们的青春才刚刚开始。”
封印黑蝶的符咒在三个月后突然自燃，小燕子在音乐课上再次听到了那股蛊惑人心的旋律。这次，整个城市的音乐设备都开始不受控制地播放诡异乐曲，无数市民眼神呆滞地朝学校方向聚集。
古巫族守护者们匆忙赶来，却发现城市地下不知何时布满了青铜制的巨型音弦，一旦全部奏响，整个世界都将沦为歌神的祭品场。
尔泰的身体里传来两个声音的撕扯，原本清澈的眼睛一蓝一红交替闪烁。他将小燕子推进学校密室，嘶吼着："带着这个！"——那是用黑蝶翅膀碎片制成的拨片，能干扰巫咒音律。
密室深处，小燕子发现了歌神的真身：一具被琴弦贯穿的骸骨，正通过城市音弦吸收人类的声音能量。
当市民组成的"活祭方阵"即将踏入校园时，小燕子抱着吉他站在顶楼，用黑蝶拨片弹奏出安魂曲的终极变奏。
乐曲与诡异旋律碰撞出音爆，城市音弦寸寸崩裂。激战中，尔泰彻底挣脱了歌神的控制，他和守护者们用古老的巫术将歌神骸骨封印在地下。
但黑蝶碎片突然化作灰烬——这意味着歌神的诅咒将以更强大的形态重生。离别时，古巫族长老凝重地说："当月亮变成血色音符，真正的终局之战才会到来。"
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