“仙械盟约”初定，联合击退古神浸染，地仙祖庭暂得喘息。外部压力稍减，内部因技术爆炸、资源丰沛带来的高速发展期仍在持续，“羲和”智脑高效运转，灵网四通八达，各殿弟子无不卯足劲头，欲在这前所未有的盛世中建功立业。然而，正如月满则亏，水满则溢，极盛之下，潜流暗生。那被辉煌成就所暂时掩盖的人心欲望、理念分歧与权力纠葛，如同蛰伏的毒虫，开始在不经意间，悄然显露獠牙。
矛盾最先在资源分配与话语权的争夺中爆发。
这一日，“百工院”下属“大型灵能符阵建造司”的执事弟子“赵乾”，怒气冲冲地闯入总部议事堂，将一枚灵气氤氲的玉简重重拍在案上，对着堂上几位长老愤然道：“诸位长老！‘巡天御风舟’三期舰体的核心动力符阵，乃当前重中之重，关乎祖庭虚空探索之大计！所需之‘星辰金’与‘虚空晶砂’，上月配额为何又被‘丹鼎阁’以炼制那劳什子‘九转还魂丹’为由，强行截走三成？此事‘羲和’智海早有最优调度方案，明确我司优先级更高！丹阁如此行事，岂非因私废公，罔顾大局？！”
端坐堂上的砺锋（岩砾）大弟子，现任百工院首席长老“铁磐”，面色沉稳，目光扫过玉简，缓声道：“赵师侄稍安勿躁。丹阁此举，亦有缘由。‘九转还魂丹’乃蒲英长老亲自主持，为救治前番受古神侵蚀、道基受损的数十位同门，此事关乎人心安定，亦非小事。且丹阁言，彼等以部分新炼制的‘蕴神丹’作为补偿，于我司弟子神识温养亦有裨益。”
“蕴神丹？”赵乾冷笑一声，声音拔高，“铁长老！蕴神丹虽好，可能让御风舟早一日巡弋虚空吗？能助吾等早日探寻更多资源星域吗？丹阁仗着蒲英长老与道祖渊源，又有救治之功，近来越发跋扈！灵材、优等地脉节点、乃至‘羲和’智海的算力配额，但有所需，无不优先！长此以往，我百工院诸多关乎祖庭未来的战略项目，何时才能推进？”
“赵师兄此言差矣！” 不等铁磐回应，一名身着丹阁服饰的年轻执事快步走入，正是蒲英的得意门生“青萱”，她面若寒霜，对着赵乾朗声道，“救治同门，稳固根基，难道不是当前第一要务？若无众多弟子安然无恙，何谈未来？况且，丹阁近年研制的‘淬体灵液’、‘破障丹’，哪一样未曾惠及百工院弟子？岂可因一时资源调配，便妄言丹阁‘跋扈’！倒是百工院，近来大兴土木，诸多项目是否必要，耗费几何，‘羲和’智海可未必能算尽人心私欲！”
“你！”赵乾勃然大怒，周身灵压微涌，“黄口小儿，安敢污我百工院清誉！”
“够了！” 铁磐一声低喝，金丹后期的威压稍稍释放，顿时让堂内剑拔弩张的气氛一滞。他眉头紧锁，心中亦是烦闷。此类争执，近来已非一次。百工院与丹鼎阁，一主造物，一主丹药，皆是祖庭支柱，往日虽有竞争，却也和谐。可自“羲和”智海推行“最优资源配置”以来，两殿对资源、对智海算力的争夺日趋激烈。智海虽能算出效率最优，却算不出人心中的秤杆往哪边倾斜，更算不出那隐藏在公事公办下的派系倾轧与个人恩怨。
“资源调配，依‘羲和’方案及长老会决议执行，不得妄议！此事我自会与蒲英长老沟通。你二人退下，各司其职，若再有无端争执，宗规处置！” 铁磐最终以权威压下此事，但看着赵乾与青萱离去时那不服气的眼神，他心中明白，这不过是冰山一角。
类似的暗流，在祖庭各处悄然涌动。
“外务堂”与“战堂”因新开拓的“寂灭荒原”管辖权归属问题，在长老会上针锋相对。外务堂主张以怀柔安抚、建立贸易点为主，战堂则强调需驻屯重兵，强力清剿残余魔物，双方皆引经据典，并拿出“羲和”智海有利于己方的推演数据，互不相让。
一些依附祖庭不久的中小部落首领，在私下聚会时，也开始抱怨祖庭“一碗水端不平”，认为资源过度向原星辉镇核心弟子倾斜，他们这些“外来户”难获重任，虽得温饱，却难攀高位。甚至有流言悄然传播，说砺锋大长老处事过于强硬，不如蒲英长老待人宽和；又说“羲和”智海权力过大，长此以往，诸位长老岂不形同虚设？
更有一丝令人不安的风声，在极少数最核心的圈子里隐秘流传：有长老对道祖（林玄）化身阵灵后，极少直接干预具体事务的现状，隐有微词。认为道祖虽功参造化，然长久脱离具体庶务，恐对下情有所隔膜，所定大方向虽好，细节处却未必全然契合当下实际。尤其与机械神教结盟一事，虽解了燃眉之急，但引狼入室之患，不可不防。这部分声音极其微弱，却如毒刺，直指祖庭权力的最核心。
这些纷争、抱怨与流言，大多被各部门执事压下，未能形成大风浪。在“羲和”智海高效的调度下，祖庭整体依旧在以惊人的速度发展、壮大。普通弟子感受到的，是日益丰富的修炼资源、越来越精妙的功法神通、以及愈发安全稳定的环境。那水面下的暗涌，非身处漩涡中心者，难以察觉。
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