蛋儿就在秦良玉于四川雷厉风行推行军制改革的同时，马祥麟在云贵地区却遇到了麻烦—那就是在历史上让人闻风丧胆的瘴疠之毒。
所谓瘴疠，主要指恶性疟疾等由湿热环境引发的传染病，尤其以疟疾为核心。
这种疾病极为凶险，在古代缺医少药的环境下死亡率极高。
甚至可以说它甚至直接影响了当前整个人类乃至中国文明的发展进程和当前世界的基本格局。
据世界卫生组织于202X年12月11日发布的《202X年世界疟疾报告》显示，202X年全球疟疾病例达2.63亿例，较上一年年增加约1100万例，其中死亡病例59.7万例。而非洲区域承担全球94%的病例和95%的死亡病例，东南亚、东地中海等地区也存在显着负担。
在医疗科技如此发达现代社会，疟疾的发病率和死亡率尚且如此恐怖，又何况是在古代医疗落后的封建时期呢？
在古代疟疾除了对人类生命造成了严重的影响之外，它还严重限制上个纪元华夏文明的传承和中国疆域的向南拓展。
古代华夏的战争大多发生在北方地区，华夏军队也都以向北、向西扩张为主，但是却很少大规模向南扩张。
其实并不是古代的统治者没有注意到南方辽阔富饶的土地，而是因为疟疾这种疾病经常会在军队中大规模爆发，而导致南征的军队大规模减员。
如三国时期，诸葛亮南征孟获时，就因疟疾爆发导致蜀军损失惨重，而且就算是蜀军一时在军事上取得了胜利却难以长期驻守，所以才有了诸葛亮七擒孟获，让孟获将那些藏在深山老林里面的部落给聚集起来。
隋朝时期，隋炀帝派刘方率军征讨林邑国（越南占城），意图扩张至中南半岛，虽然隋朝凭借强大军力很快就占据临邑，但是隋军士兵却因感染了疟疾，死者十之三四。《隋书》载：“士卒肿足，死者十四五，方亦患脚肿，卒于道。”
唐朝时，唐玄宗征南诏时也因瘴疠致全军覆没。《资治通鉴》称“士卒罹瘴疫及饥死什七八”。
哪怕是征服大半个亚欧大陆的蒙元，也是同样因疟疾遭受到了重大的损失。元朝在征缅甸时，虽然很轻松的就占领了缅甸，但是在后期长期驻扎时确因“瘴疠”而减员严重。《元史》记载：“军还，为瘴毒所侵，死什七八。”
在这样的情况下，古代华夏军队虽然能够打败并占领东南亚地区，但可惜的是却始终不能适应南方的气候，尤其是难以承受疟疾这种疾病给南征军队带来的巨大损失。
所以古代的各个朝廷不得不依赖当地的土人对南方湿热地区进行治理，这才有了南方地方土司的逐渐坐大。
不过一心向南开疆拓土的朱常洛对此也是早有准备。
早在大明皇家商行成立之初，朱常洛就多次召见了大明皇家商行的技术主管宋应星，将一份关乎南国命运的绝密任务交予了他。
“宋卿，此物名为‘黄花蒿’，”朱常洛指着让锦衣卫特意找来的一丛不起眼的青蒿植物，神色凝重的说：“古籍有载，其汁可截疟。然生服效微，朕有一法，或可提其精髓。”他随即将利用高度酒精浸取、浓缩黄花蒿有效成分的初步构想和盘托出。
宋应星虽对“疟疾由微小虫蠓经蚊虫叮咬传播”这一皇帝提出的前所未闻的理论感到震惊，但他更相信皇帝超越时代的见识与皇家商行强大的执行力。
领命之后，宋应星不敢有丝毫怠慢，立即以大明皇家商行医药部的名义，广发英雄帖，征召天下精通药理、勇于探索的医者。一时间，各地名医、草药郎中等纷纷汇聚北京。在这群人中，一位刚刚考中贡生，却对仕途经济兴趣索然的年轻人引起了宋应星的注意，他便是喻嘉言。
历史上的喻嘉言官场失意后终成明末清初着名医学家，而此刻，他那份专注于医道的天赋已然初露锋芒。朱常洛在得知此人被招募后，特意示意宋应星对其多加关注和培养。于是，喻嘉言被直接吸纳进核心研发团队，投身于这场与瘴疠争分夺秒的赛跑。
在朱常洛提供的理论指引和皇家商行充沛资源的支持下，喻嘉言凭借其过人的医学悟性和严谨的试验精神，带领团队不断优化提取工艺。他们尝试不同的酒精浓度、浸泡时间、压榨与萃取方法。经历了无数次失败与调整后，终于，他们成功地从黄花蒿中用酒精提取出了一种带有特殊气味的琥珀色结晶物。
初步的临床试验在京师由刑部提供的、自愿参与实验的死囚中进行。
结果令人振奋：那些被故意感染了疟疾的死囚，在服用此结晶物后，高热迅速消退，血液中的疟原虫数量急剧减少，死亡率远低于仅服用传统常山、柴胡等药物的对照组！
捷报传至宫中，朱常洛大喜过望，亲自将此神效结晶命名为“青蒿素”。
他立即下令，皇家商行所属制药厂开足马力，优先生产青蒿素，同时将提取方法与临床数据整理成册，快马加鞭送至秦良玉与马祥麟军中，并开始在云贵川疫病高发区推广使用。
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