1966年1月19日，经过半个月的谈判，各方达成协议。
第一条：西马来西亚、新加坡、廖内群岛、纳土纳群岛、阿南巴斯群岛，全部并入南华本土。自此，南华占据了全部马来半岛。
第二条：马来西亚联邦中央政府和首都迁徙到山打根，并只剩下加里曼丹岛北部，也就是原东马来西亚的土地。
第三条：加里曼丹岛以卡扬河、拉让江为界，北部属于马来西亚联邦。
第四条：为取得英国支持，给马来西亚联邦制造后期隐患，南华将林梦河以东的地区（马来西亚砂拉越州一部分，约6000多平方公里），划给文莱（国防、外交仍由英国负责），使文莱领土增加约1倍，主要是让文莱东西两部分连为一体，国土达到约1.1万平方公里。
第五条：加里曼丹岛在卡扬河、拉让江以南地区，加上勿里洞岛及周边岛屿约56万平方公里，建立新的华人国家——明华共和国。寓意，日月照耀下的华人国度。
为明确两国边境，以河为界，修了约150多公里的人工河连接卡扬河、拉让江的上游，命名为“明华河”，宽20-30米，方便泄洪也是界河。
从此，不管马来西亚联邦是否愿意，两国以卡扬河、明华河、拉让江为界分南北。
明华共和国以中文为官方语言，定都坤甸。宁祥雨担任国家总统，萧玉灿担任副总统，黄自达担任政府总理。
全面普及汉语教学，实行9年义务教育，教材和南华通用。登记户口一律使用四字以下的百家姓中文名。
为方便统治和后期开发，在周青云的建议下，前期首都暂时设在坤甸，后期政权稳定后迁到马辰，并改名为应天市。
卡扬河改名为华扬河，拉让江改名为华威江，勿里洞岛改名为汉唐岛。
明华共和国成立后，南华停止了对外来华人的大规模入籍。除了高学历素质人才、高级技工、抗战英雄及其后代（经查询本人在抗战时期保家卫国有重要贡献，其本人和子女、孙子孙女、外孙子外孙女可以直接入籍，但入籍的人数不许超过6人）外，其他人移民到明华，充实当地华人。
明华共和国的国旗，参考日月星辰旗，蓝色底，右下角小篆黑色字体“炎黄”。
为解决民族矛盾为理由，在南华军队和20万波罗治安军的维持下，实行为期3年的人口大迁徙。
——马来半岛的马来人、明华共和国的马来人，一律迁移到加里曼丹岛北部的马来联邦。
——之前印尼的华人，包括苏门答腊岛、爪哇岛、苏拉威西岛、新几内亚岛和周边群岛等地的华人，一律迁徙到人口相对稀少的明华共和国。
苏门答腊岛建立各民族联合成立的联邦国家——苏门答腊联邦，首府巨港。
为取得美国支持，经过谈判，南华派兵不少于5万人支援越南西贡政权，但只负责防守南越。周青云在波罗托管区，学习之前朝鲜战场的操作，强制征召反波罗托管区的印度教徒、穆斯林聚集地的青年参军，组成4个师约4.6万人，剩余以佛教徒为主成立一个旅类似监工性质，招聘大批退役南华老兵当军官和宪兵，送到南越给美国交差。
以帝汶岛、罗地岛及附属小岛为领土，成立帝汶民主共和国，以帝力为首都。此地大多数人口信奉基督教（尤其天主教派），混血人种为主，主要是巴布亚族与马来族或波利尼族的混血人种，还有部分葡萄牙人和当地土着混血的梅斯蒂索人。
在南华建议下，澳大利亚在帝汶民主共和国驻军，在帝力一个港口区租给澳大利亚。
原印尼总统苏加诺被释放，担任新的印尼总统。印尼被肢解，丧失了约56%的领土，元气大伤。
为取得英国对谈判的支持，新成立的苏门答腊联邦、帝汶民主共和国加入英联邦，以英国女皇为元首。
为弥补损失，周青云下令把原马来西亚和印尼两国国家银行的黄金储备、国家仓储的重要物资全部没收运回南华。
黄金储备拿出1成，送给出兵参战的云华共和国。
又拿出1成，送给新成立的明华共和国，用来建设国家。
这场南洋战争，被李弥和余程万等人称为“大人打小孩的战争”，赢得非常轻松。
战争结束后，在英国的调解下，马来联邦的俘虏被释放，送到山打根。
但鉴于印尼大规模屠杀华人，就没有这么客气了。
抓获的印尼俘虏和参与屠杀华人的人员、涉及家属，约80多万青壮年，除了处死的近1万人外，其他人处理如下：
——10万人分配到云华共和国，从事重体力劳动5-10年。
——20万人分配到新成立的明华共和国，在加里曼丹岛的热带雨林从事重体力劳动5-10年。
——剩余50万人分配到南华，在南华从事基建重体力劳动5-10年。
这群印尼人长期在热带雨林从事危险且繁重的体力活，后面只剩下40多万人。
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