他们重新调整了编纂团队。除了秦济和林越（及李墨），留下了三位相对开明、且各有专长的中年医者：一位擅长内科杂病，一位精通外伤正骨，还有一位是药铺坐堂、熟知药材的司药。此外，林越还特意请来了“第一坊”蒙学班的徐老先生，负责文字润色，确保通俗而不失准确；请李墨和刘寡妇（她心细手巧）负责根据描述绘制示意图。
编纂过程极其繁琐细致。秦济和三位医者先就每一个条目进行讨论，确定最稳妥、最核心的知识点，然后由林越和李墨转化为口语化的叙述。常常为了一个症状描述的措辞，或一味简易药材的用量禁忌，反复争论、查证古籍、结合民间经验。
例如，写到“小儿发热”，不仅要描述不同热度的可能原因（受凉、积食、出疹等），更要强调“何时必须立即就医”（如高热抽搐、精神萎靡、呼吸急促），以及在家可用的物理降温方法（温水擦拭部位、不要捂汗），并配以简单图示。写到“腹泻”，则要区分寒热、有无脓血，强调“防止脱水”的饮水方法（少量多次喝淡盐水或米汤），并明确指出哪些食物暂时不能吃。
“急救篇”是重中之重，也是难点。林越结合前世急救知识，提出了“止血（压迫、包扎）”、“烧伤烫伤（冲冷水）”、“异物卡喉（背部拍击、腹部冲击）”、“中暑（阴凉通风、补水）”、“冻伤（缓慢复温）”等基本流程。这些方法在此时代医书中或许未有系统记载，或与某些民间土法相悖。秦济等人起初亦觉新奇甚至存疑，林越便找来动物或模型反复演示原理，并援引实际案例说明传统某些做法（如烫伤抹酱油、卡喉吞饭团）的危害。经过激烈辩论和谨慎验证，最终将其中公认安全有效的方法精简后纳入，并格外强调“首先确保环境安全”、“尽快寻求专业帮助”。
“简易方药篇”则严格限定范围，只收录如生姜红糖水驱寒、绿豆汤解暑、金银花露清热、葱白豆豉汤治轻症风寒等近乎食疗的方案，且每一条都附上“适用于……”、“不适用于……”、“如无效或加重请停用并就医”的明确提示。
“妇幼篇”由那位留下的妇科医者和刘寡妇（作为女性代表）共同斟酌，措辞极其谨慎，重在孕期营养、产后调养、婴幼儿护理常识和危险信号识别，避免涉及具体治疗和隐私细节。
“禁忌篇”则直指流传甚广的谬误，如“发烧捂汗”、“腹泻禁食”、“伤口撒香灰”、“孕妇不能动剪刀”等，用简明的道理予以澄清。
除了文字，李墨和刘寡妇绘制的示意图成了手册的另一亮点。发热小儿额头敷毛巾的姿势、伤口包扎的步骤、心肺复苏的按压位置（简化示意）、甚至如何正确洗手，都用线条简单的图画表现出来，即使不识字的人，看图也能明白个大概。
编纂工作夜以继日，持续了近两个月。初稿形成后，林越又组织了一次小范围的“审阅”：请来几位识字的街坊代表（包括曾受训的看护）、蒙学班的徐老先生和赵廪生、甚至“第一坊”的几位织女，让他们试读，提出哪里看不懂、哪里觉得不实用、哪里还有疑惑。根据反馈，再进行修改、润色，务必让尽可能多的人能理解。
当厚厚一叠散发着墨香的手稿最终定稿，交到秦济手中做最后医理核定时，老大夫抚摸着稿纸，眼中竟有些湿润：“字字斟酌，图图用心，老朽行医数十载，未尝见有如此为民着想之医书雏形。此册若成，功德无量。”
然而，就在众人准备联系刻书坊刊印之时，新的风波悄然而至。州城一家颇有影响的医馆“回春堂”，其东家兼坐堂名医孙老先生，突然在某次士绅聚会上，公开对这本“尚未面世”的手册提出了严厉批评，指其“撺掇百姓自医，败坏医道正统”，“所列方药简陋可笑，恐贻误病情”，“绘图粗俗，有辱斯文”。孙老先生在州城医界声望颇高，门生故旧众多，他这一表态，顿时引来不少附和之声，连之前参与编纂但因故退出的一位老大夫，也出来说了几句“早知如此”的风凉话。
压力，再次扑面而来。这一次，是来自“专业权威”的否定。刻书坊那边也传来消息，有些犹豫，怕惹上麻烦。
编纂完成了，但要让这手册真正“活”起来，送到百姓手中，似乎还有一道无形的、由“规矩”与“权威”筑起的高墙需要跨越。林越知道，这场关于“知识是否应该共享”的博弈，远比想象中更加复杂。他必须想办法，让这凝聚了众人心血、旨在惠民的手册，冲破桎梏，见到阳光。而下一章，或许就该是面对质疑，寻求更高层面的认可与支持了。但无论如何，这本《常见病防治手册》的诞生本身，已标志着一种新的、更加普惠的医卫观念，开始在州府的土地上萌芽。
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